Quina diferència hi ha entre l'ARNr 16s i l'ARNr 18s?
Quina diferència hi ha entre l'ARNr 16s i l'ARNr 18s?

Vídeo: Quina diferència hi ha entre l'ARNr 16s i l'ARNr 18s?

Vídeo: Quina diferència hi ha entre l'ARNr 16s i l'ARNr 18s?
Vídeo: ПИРОЖОК. МЯСО с КАРТОШКОЙ. КАЗАН КЕБАБ. Рецепт. Одесса. ENG SUB 2024, De novembre
Anonim

El principal diferència entre realitzant anàlisis amb ARNr 18S dades genètiques en lloc de ARNr 16S Les dades gèniques (o dades ITS) són la base de dades de referència utilitzada per a la selecció d'OTU, les assignacions taxonòmices i la construcció d'alineació basada en plantilles, ja que ha de contenir seqüències eucariotes.

Tenint en compte això, per què s'utilitza el gen rRNA 16s per a la identificació?

El Gen de l'ARN ribosòmic 16S codifica el component d'ARN de la subunitat 30S del ribosoma bacterià. A causa de la complexitat de la hibridació ADN-ADN, Gen de l'ARNr 16S la seqüenciació és utilitzat com a eina per identificar bacteris a nivell d'espècie i ajuden a diferenciar entre espècies bacterianes estretament relacionades [8].

A més, els eucariotes tenen ARNr 16s? El ARNr 16S El gen està present en tots els bacteris i una forma relacionada es produeix a totes les cèl·lules, incloses les de eucariotes.

També la pregunta és, què és l'ARNr 18s i 28s?

El 28S / ARN ribosòmic 18S La relació s'utilitza sovint per avaluar la qualitat de l'ARN total purificat a partir de qualsevol mostra determinada. En humans, ARNr 28S té ~ 5070 nucleòtids, i 18S té 1869 nucleòtids, el que dóna a 28S / 18S relació de ~2,7. Un alt 28S / 18S La proporció és una indicació que l'ARN purificat està intacte i no s'ha degradat.

Què és la seqüenciació d'ARNr 16s?

ARNr 16S gen seqüència L'anàlisi és un mètode estàndard en taxonomia i identificació bacteriana, i es basa en la detecció de seqüència diferències (polimorfismes) en les regions hipervariables de la ARNr 16S gen que està present en tots els bacteris.

Recomanat: